Vườn quốc gia nằm ở khu vực trung tâm phía nam của Mindoro thuộc các đô thị Sablayan, Calintaan, Rizal, San Jose của Occidental Mindoro, và Bongabong, Mansalay của Oriental Mindoro.[4] Nó có địa hình hiểm trở bao gồm các sườn dốc, hẻm núi sông, núi và cao nguyên. Ở phần phía bắc của vườn quốc gia là núi Baco cao 2.488 mét (8.163 ft) so với mực nước biển. Núi Iglit cao tới 2.364 mét (7.756 ft) nằm ở phía nam của núi Baco.[3] Vườn quốc gia có 8 con sông chính chảy qua, bao gồm cả sông Lamintao và Anahawin đổ ra biển Đông.

Đây là nơi sinh sống của một số dân tộc như Batangan, Mangyan, Hanunu'o và Bangan.[5] Người Mangyan phụ thuộc vào khu vực này khi có các hoạt động canh tác truyền thống và săn bắn động vật trong vườn quốc gia. Điều này đã khiến nhiều đồng cỏ trở thành các bãi chăn thả gia súc cũng như nhiều khu vực nông nghiệp đốt nương làm rẫy.[5]